離子色譜儀主要是利用離子交換來進行分離的，其主要是用于環境樣品的分析和檢測，如：地面水、雨水、生活污水和工業廢水等，通過利用離子色譜儀，能夠準確的檢測出樣品中的陰、陽離子，從而對數據進行分析，來了解樣品中是否含有危害人們身體健康的物質。同時，隨著經濟和技術的不斷進步，離子色譜儀也開始應用于微電子工業廢水和試劑雜質的檢測和分析，為電子產品的質量把關，也作為高新的技術手段，受到國內許多廠家的青睞。
離子色譜儀的輸液系統：
輸液系統主要包括淋洗液貯罐、淋洗液泵、進樣閥等。一般商品儀器均配有聚丙烯或高密度聚乙烯材質的耐壓淋洗液貯罐及再生液貯罐。在配制各種淋洗液和再生液時應使用電導率小于0.06μS/cm的去離子水，水中不應有大于0.2μm的顆粒物和微生物，以免污染和堵塞色譜柱、泵、閥門及流路系統中的其它部件。
淋洗液泵是離子色譜儀的重要部件。由于色譜柱很細(2mm～5mm)，填料粒度很小(常用顆粒直徑為5μm～10μm)，因此阻力很大，為達到快速、高效的分離，必須使用高壓輸液泵。對高壓輸液泵來說，一般要求壓力為150Pa～350×105Pa，關鍵是要流量穩定，因為它不僅影響柱效能，而且直接影響到峰面積的重現性和定量分析的精密度，還會引起保留值和分辨能力的變化；另外，要求壓力平穩無脈動，這是因為壓力的不穩和脈動的變化，對很多檢測器來說是很敏感的，它會使檢測器的噪聲加大，儀器的*小檢測量變差；對于流速也要有一定的可調范圍，因為淋洗液的流速是分離條件之一。現代離子色譜儀多采用用微機控制的高精度無脈沖雙往復泵。
在離子色譜中，進樣方式及試樣體積對柱效有很大影響。為了保證測定的精密度，幾乎所有離子色譜儀均采用進樣閥進樣。通過進樣閥(常用六通閥)直接向壓力系統內進樣而不必停止流動相的流動。六通進樣閥的原理如圖5-10所示。操作分兩步進行。當閥處于裝樣位置(準備)時，1和6、2和3連通，試樣用注射器由4注入到一定容積的定量環中。根據進樣量的大小，接在閥上的定量環按需要選用。注入的試樣溶液的量要比定量環的容積大，多余的試樣溶液通過連接6的管道溢出。進樣時，將閥芯沿順時針方向迅速旋轉60°，使閥處于進樣位置(工作)，這時1和2、3和4、5和6連通，將貯存于定量環中固定體積的試樣送入分離柱中。
