光譜儀充分利用了狹縫高度方向入射的光線，從而較大地增強了QE65000的系統靈敏度。在海洋光學的光譜儀中，通過選擇不同的狹縫寬度來控制進入光學平臺的光強。而目前大部分的光譜儀都采用線性CCD探測器，所以從狹縫高度方向入射的光線不會被系統充分利用，而QE65000科研級光譜儀采用的是面陣CCD，因此能夠采集到更多的光線，它非常適合亮度較低的熒光應用。
光譜儀的基本操作步驟：
1、打開紅外光譜儀的電源開關。
2、點擊電腦屏幕打開IRsolution工作站軟件。
3、點擊測定，使屏幕轉到測定界面。之后初始化儀器。
4、制備溴化鉀空白片和樣品壓片。
5、將壓制好的溴化鉀空白片(不含樣品的溴化鉀空片)放入光譜儀樣品倉內的樣品架上。
6、點擊測定按鈕下的背景按鈕，輸入光譜名稱，確認采集參比背景光譜。
7、背景譜圖采集完畢后，將待測樣品片放入光譜儀內，關上倉蓋。
8、軟件可按要求對譜圖進行各種分析處理，從文件菜單中選擇打印，將譜圖以不同形式打印出報告。
9、退出系統。
光譜儀的使用注意事項：
1、儀器一定要安裝在穩定牢固的實驗臺上，遠離振動源。
2、供試品測試完畢后應及時取出，長時間放置在樣品室中會污染光學系統，引起性能下降。樣品室應保持干燥，應及時更換干燥劑。
3、所用的試劑、試樣保持干燥，用完后及時放入干燥器中。
4、在工作期間，不可中途斷電。
5、壓片模具及液體吸收池等紅外附件，使用完后應及時擦拭干凈，必要時清洗，保存在干燥器中，以免銹蝕。
6、光路中有激光，開機時嚴禁眼睛進入光路。
7、測定完畢，要及時做好儀器使用登記記錄。
